今日自闭症关于自闭症的原因，部分专家认为，可能和母亲在孕期滥用抗生素类食物或药物有关。
研究发现，自闭症患者普遍存在肠胃异常，如腹痛、腹泻、胀气、便秘以及多屁等，而自闭症儿童肠道内益生菌的种类和数量都要少于同孩子。这表明，自闭症患者与普通人的肠内微生物菌群存在很大差异。
肠内微生物菌群对人类大脑的发育和行为表现有很大作用，它们会通过神经内分泌、神经免疫和自主神经系统来与大脑沟通，调控大脑的工作。婴儿体内微生物的最初来源是母体，如果孕妇体内的微生物菌群不平衡，新生儿体内的微生物菌群也会随之不平衡。
大量研究表明，剖腹产容易造成新生儿体内的菌群失衡，这类婴儿体内的菌群中，主要是葡萄球菌，它们来自母亲的皮肤。而顺产的婴儿出生第一时间接触的是母亲的阴道，阴道中乳酸菌等益生菌占主导。因此，顺产的婴儿体内菌群平衡程度良好。
导致亲体菌群不均衡的因素主要包括：
1、饮食不当，经常吃甜食、精加工食品和含化学物质的食品，这些食品加速了致病菌的生长，并抑制益生菌的生长。
2、使用的抗生素杀死了益生菌。大量调查结果揭示，母亲在怀孕期间使用多种抗生素，会给孩子带来患自闭症的潜在风险。
3、孕期肥胖和妊娠糖尿病能够改变准妈妈肠内菌群的平衡，或许会进一步诱发新生儿自闭症。
4、调查结果显示，与母乳喂养相比，吃配方奶长大的婴儿，体内艰难梭状芽孢杆菌要多的多。
在研究界流传着一种说法：自闭症的根源不在大脑，而是消化系统出了问题。如果这种说法成立，肠胃问题诱发自闭症，主要通过两个途径来实现：1、肠内毒素（肠内微生物菌群不平衡，过度生长的致病菌释放大量毒素）。2、肠漏（肠漏导致免疫系统释放大量的炎性物质，损伤大脑）。
无论抗生素是否是诱发新生儿自闭症的原因，准妈妈在孕期都要防止服用。因为即便对于正常人，滥用抗生素都会产生严重的副作用。
