今日自闭症有些时候，孩子为求得注意，表现出撞头、摔易碎的东西，或是抓大人的头发、踢大人等攻击性行为，就不得不注意，并使用隔离室的做法了。也就是在孩子出现不当行为时，立即把他送进隔离室内，等孩子的情绪平息些，才将他放出来。由于这是相当强制性的严格做法，在实施时必须切记：
(1)隔离室的空间必须是单调而封闭的，使得孩子在短时间内得不到任何注意或其他强化物。因此，把孩子关在游戏室或是卧室内并不理想。
(2)必须在孩子一出现不当行为时，立即走到他身边，做简短说明后(如说：小宝不乖，要关房间!)就将他关入隔离室。
(3)在带人隔离室后，除非孩子仍持续其不当行为(大声哭闹，踢东西或撞墙等)，一般而言，只能让他隔离2—5分钟。
(4)如果孩子仍在隔离室持续吵闹，顶多将上述的隔离时间加倍，待其稍静些就让他出来。
(5)孩子出来后，不要再指责他，可稍稍安慰他，并告诉他，因为他不乖，才被关进房间。
采用隔离室的作法，第一个会碰到的困难，是家里很难找到合适的隔离室——既单调又有诸多保护性的设备(墙壁要软质)。所幸的是，大部分有这类问题的孩子，都害怕与大人分开，害怕被大人拒绝，因此，只要避开孩子较喜欢呆的空间，一般都会有好的效果。除非孩子还伴随着较危险的自我伤害行为，这时的处理方式就变得不同。其次，不论是用哪种方式处罚孩子，在开始时，他们的不当行为大半都会变得更激烈，或持续得更久些，几次之后，这类不当行为才会开始消减。孩子常常是一方面在生气，一方面也在适应这个新方法，自然地需要一些时间去改变，训练者一定要有耐心并坚信这样做的效果。