今日自闭症自闭症发生在从弱智到超常的所用智力水平的孩子身上。但是，大多数自闭症儿童的智力都低于常人。拥有正常智力的患儿只有约20%，轻度至中度智力障碍占30%，重度和极重度智力障碍占42%，所谓的自闭症天才只是少数。
用标准的智力测试来测自闭症患者时，会产生一些问题。例如，由陌生人在陌生环境中进行测验，会刺激患儿的妨碍性行为。患儿要是拒绝接受测试，并出现自我刺激、自伤行为甚至攻击性行为，是否该立即停止测试或至少是推迟一段时间呢？测试者是否在所有的测试项目上给患儿低分呢？在解读IQ分数的时候，公平性评估小组必须要知道测试是在何种条件下进行的。因为实施恰当的测试，能鼓励自闭症患儿在标准的智力测试中集中注意力并提高动机，使他们获得良好的测试成绩。
许多自闭症患者都存在明显的感觉和运动障碍，一些人对感觉刺激反应不足，一些则反应过度。他们可能会因为无法过滤无关信息而造成信息超负荷。例如，自闭症患者唐娜·威廉斯曾深受信息超负荷的困扰，她把自己的感觉通道比作声音通道，说她经常用单一的、而不是多重的通道模型来进行信息加工。
自闭症也与运动性障碍有关，运动障碍在患儿出生4-6个月时，甚至是在新生儿期就能被诊断出来。具体表现包括体态的异常，眼睛运动的异常，头、身体、面部、四肢的运动异常；重复的动作和手势，笨拙的走路姿势等。进行运动障碍评估，可以让孩子在很小的时候，甚至是婴儿期就诊断出是否患有自闭症。
