今日自闭症孤独症谱系障碍并不是我们通常所说的“精神病”但，可能被误诊为三种精神疾病，任何一种错误断都会导致错误的治疗、康复方法和长期护理。
第一类误诊是错把没有合并症的孤独症障碍当成是精神病。未经被诊断为孤独症障碍的、具有边界能力、平均能力及超常能力的成人，曾被误诊为有精神病。最常见的误诊包括强迫症、抑郁症和精神分裂症等。医生必须从家长那里获得患者的全部发育史，包括所有的有关细节，才能做出正确的诊断。
通常来说，青少年期或成年期的精神病（包括精神分裂症）出现在儿童期并导致行为异常的情况非常罕见，应当根据病史及行为观察把它们和孤独症区分开来。儿童期精神分裂症十分罕见，还没有从1岁之前就开始的病例。有一类孤独症儿童，他们的社会性亲近表现得主动却又很古怪，他们有许多重复性言语，也能进行假想装扮游戏。在这类孤独症儿童身上，很容易出现诊断的混淆。精神分裂症的特点是妄想与幻听，这就意味着，只有当孩子有足够的言语并出现这些现象时，才能做出这一诊断。
“精神分裂样人格障碍”的诊断引起了某些混滑。对“精神分裂样人格”这类人的种种描述，无疑包括了一些有孤独症谱系障碍的人，尤其是阿斯伯格综合征。ICD-10关于精神分裂样人格障碍的诊断标准包括情感淡漠、向他人展示热情的能力有限、总是选择单独的活动、没有任何亲密的朋友等，而这些都会在孤独症障碍中出现。
专家对符合“精神分裂样人格障碍”诊断标准的成人进行了一项研究，发现他们中的许多人具有可诊断为孤独症系障碍的发育史。对于那些行为表现从儿童早期以来与阿斯伯格所描述的一模一样的青年人，一些研究人员使用“精神分裂样人格障碍”这一词汇来称呼他们。显然，从事儿童工作与从事成人工作的精神科医生看到了同一类人，但由于是在这些人的不同人生阶段看到的，因面他们会对同样的人给予不同的诊断结果。
“精神分裂样人格障得”的临床表现与高功能孤独症谱系障碍并不完全相同，但有很多交叉。“精神分裂样人格障碍”这一术语暗示患者与精神分裂症有联系，但并没有证据可以证明，孤独症患者要比普通人更容易在成年后患精神分裂症。说某个人有“精神分裂样人格”，无助于治疗或康复服务。相反，如果把它分类到孤独症谱系障碍中去，由于大家都知道这是一种发育障碍，就能准确研究出是哪个方面的发育受到了影响，考虑采取什么办法来减轻问题行为。这种途径有助于有孤独症谱系障碍的人们，因此，这种诊断分类是应当被推荐。
第二类误诊是漏诊了与孤独症障碍并发的某种精神疾病。容易漏诊是因为医生很难从孤独症障碍患者那里得到全面的、表达清楚的症状史。从家长及其他照顾者那里获取信息是必不可少的，尤其是要获取偏离了以往行为模式的最新变化信息。
第三类误诊是诊断出了精神病，却没能识别出存在孤独症障碍。当存在精神病的充分证据，医生却未曾询问家长发育史的时候，就可能出现这种情况。如果对精神病做出诊断和治疗的精神病科医生具有一些治疗孤独症障碍成人的经验，而且能敏锐地发现患者在沟通和社交方面的古怪表现，就能得到补救。
