今日自闭症经常出现爸爸妈妈问：“生了一个自闭症的孩子以后，下一个都是自闭症小孩的几率有多少个？”在讨论这种情况时，自闭症患者智力的高低至关重要，假如患者智力比较低，其同胞们都是自闭症的几率约1/50；假如是高功能自闭症患者，其几率降至1%。此项数据表明，自闭症和智能不足密切相关，要探讨自闭症的基因遗传就要先搞清智能不足这一因素。
X染色体敏感症是X染色体长臂远程控制有一段不容易上色、非常容易破裂。患X染色体敏感症的患者，虽然也有叙述他的协作、开心、心态和行为都是正常的，但有更多的叙述他们是过动、不专心、绕开视野触碰、常同个人行为、自我伤害及攻击的，特别是过动与不专心的，80%之上的男士患者都是有此状况。因为发生交流障碍、绕开视野触碰和常同个人行为等自闭症特点，一部分X染色体敏感症的患者遂被诊断为自闭症。
但自闭症有非常严格临床诊断标准，并且各汇报临床诊断标准不完全相同，因此要统计分析X染色体敏感症中的男士患者有多少个展现自闭症，这很难与现有的汇报进行综合较为。依据Bregman等的综合统计分析，六个研究532位男士X染色体敏感症的患者中，122位（23%）展现自闭症。她们统计分析十个研究594位自闭症患者中，50位（8.4%）展现X染色体敏感症。但后面汇报发觉，自闭症与X染色体敏感症的关联反倒比不上智能不足与X染色体敏感症之间关系密切。
自闭症遗传学基因如何查询呢？除开X染色体出现异常以外，研究工作人员发觉，自闭症患者的许多染色体也存在出现异常。除开第12、14和20对染色体以外，其他19对染色体及X、Y染色体都曾经在自闭症患者的身上被发现了存有出现异常，其中以15、X、7、10、16和17染色体发现异常几率比较大。自闭症患者的同胞兄弟姐妹也患自闭症的几率为普通人的75-150倍，双胞胎患自闭症的一致率是60%-90%，而双胞胎患自闭症的一致率仅是0-10%，为此测算自闭症的遗传率达91%-93%。这种资料显示出自闭症和基因遗传有密切关系。
研究说明，自闭症并不符单基因遗传的特点，因而自闭症是多基因基因遗传的可能性较大。英国的研究者规模性搜集自闭症患者以及一、二、三等亲的行为特点，发觉自闭症在一等亲的发生率较高，在二、三等亲的出现率大幅下降，据其材料推估，自闭症的基因少则2个，更多就是可以达到10个，最可能是指3个基因。欧美国家有多个核心协同研究自闭症的基因，曾汇报自闭症的基因在第7染色体，但接着又被打倒。
自闭症遗传学基因如何查询？现在还没有科学合理的检查方式。在投入大量人力资源、经费预算的海外协作下，再加上人们基因组图普研究的深层次，在未来几年自闭症研究必然会有重大进展，但是即便寻找基因，仍有更多后面研究要表明基因—蛋白—脑结构—脑功能—个人行为相互关系。但大部分家庭只有一个自闭症患者，这表明自闭症是基因基因突变而来的占绝大部分，因而，从发觉自闭症基因到自闭症的治疗和预防，仍然是一条漫长的研究之途。